¿Qué es la vigilancia genómica?

Definiciones clave

• Mutación: una mutación se refiere a un cambio único en el genoma del virus (código genético). Las mutaciones ocurren con frecuencia, pero solo a veces modifican las características del virus.
• Linaje: un linaje es un grupo de virus estrechamente relacionados con un ancestro en común. El SARS-CoV-2 tiene muchos linajes; todos causan el COVID-19.
• Variante: una variante es un genoma viral (código genético) que puede incluir una o más mutaciones. En algunos casos, un grupo de variantes con cambios genéticos similares, como un linaje o grupo de linajes, puede ser designado por las organizaciones de salud pública como una variante de preocupación o una variante de interés (VOC y VOI, por sus siglas en inglés, respectivamente) debido a atributos y características compartidas que pueden requerir medidas de salud pública.
• Secuenciación genómica: los científicos utilizan un proceso denominado secuenciación genómica para descifrar el material genético de un organismo o virus. Las secuencias de muestras obtenidas pueden compararse para ayudar a los científicos a hacer un seguimiento de la propagación de un virus, cómo está cambiando y cómo dichos cambios pueden afectar a la salud pública.
• Vigilancia genómica: los virus pueden ser rastreados a través de los datos de secuencia genómica recopilados por los CDC y sus socios. Una vigilancia efectiva no requiere de la secuenciación de una muestra de cada caso de COVID-19. En su lugar, los científicos cuentan con la recopilación de suficientes datos de secuencias de poblaciones representativas para detectar nuevas variantes y monitorear las tendencias de las variantes en circulación.

Todos los virus cambian (o mutan) a medida que se replican y propagan en una población. Los virus que tienen ARN como material genético, como el SARS-CoV-2 (el virus que causa el COVID-19) y la influenza, mutan mucho más rápido que los virus con ADN. Cada vez que el SARS-CoV-2 se replica, existe la posibilidad de que el virus cambie. Muchas mutaciones no afectan la capacidad del virus de propagarse o de causar enfermedades porque no alteran las principales proteínas involucradas en la infección y la transmisión.

Cuando uno de estos cambios incide en la capacidad del virus de propagarse o causar la enfermedad, puede haber una ventaja competitiva sobre los otros linajes del SARS-CoV-2. Con el tiempo, ciertos linajes con estas ventajas se vuelven más predominantes entre los virus que circulan en una población. Cuando un linaje o un grupo de linajes tiene características que afectan a la salud pública, los CDC pueden clasificarlo como "variante de interés" o "variante de preocupación" .

Para obtener más información acerca de cómo cambian los virus con el paso del tiempo, visite Información para entender qué son las variantes.

¿Cómo los científicos hacen un seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2?

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Los científicos utilizan la secuenciación genómica para identificar qué variante del SARS-CoV-2 se encuentra en una muestra. Los científicos acumulan constantemente secuencias y analizan las similitudes y diferencias entre ellas a través de un proceso denominado vigilancia genómica. A través de la vigilancia genómica, los científicos hacen un seguimiento de la propagación de las variantes y monitorean los cambios en el código genético de las variantes del SARS-CoV-2. En forma conjunta, esta información se utiliza para comprender mejor cómo las variantes pueden afectar a la salud pública.

A medida que los CDC y los socios de salud pública realicen la secuenciación de una mayor cantidad de genomas del SARS-CoV-2, mejoraremos nuestro conocimiento acerca de las variantes que circulan en los Estados Unidos, la rapidez con la que aparecen las variantes y qué variantes son las más importantes para caracterizar y monitorear.

¿De dónde surgen los datos para la vigilancia genómica?

Los científicos utilizan un proceso llamado secuenciación genómica para identificar las variantes del SARS-CoV-2. Los científicos secuencian las muestras virales tomadas de una parte de las muestras de personas que dan positivo en la prueba de detección del COVID-19. Una vez que se determina que el resultado de la prueba es positivo, se necesita más tiempo para preparar y secuenciar la muestra viral, y luego analizar los datos de la secuencia. Esto puede demorar desde unos días hasta unas semanas.

¿Por qué es importante la secuenciación genómica?

Estas secuencias tienen información valiosa que los científicos utilizan para:

1. Caracterizar el virus
2. Estimar la prevalencia de una determinada variante en una población
3. Evaluar la efectividad de los tratamientos médicos, como los anticuerpos monoclonales, contra las variantes
4. Investigar la propagación del virus durante los brotes

¿Cómo funciona la secuenciación genómica?

La secuenciación genómica va más allá de las pruebas de detección del SARS-CoV-2 y permite que los científicos puedan clasificar un virus como una variante específica y determinar su linaje. La vigilancia genómica ha sido un componente clave de los esfuerzos de salud pública durante la pandemia de COVID-19. Lea más sobre el proceso de secuenciación genómica.