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Actualización importante: establecimientos de atención médica
Los CDC han actualizado algunas de las formas de operar los sistemas de atención médica de manera efectiva en respuesta a la vacunación contra el COVID-19. Conozca más
ACTUALIZACIÓN
Dada la nueva evidencia sobre la variante B.1.617.2 (Delta), los CDC actualizaron la guía para personas con el esquema de vacunación completo. Los CDC recomiendan el uso universal de mascarillas en espacios cerrados por parte de todos los maestros, miembros del personal, estudiantes y visitantes de escuelas de kínder a 12.º grado, independientemente de su estado de vacunación. Los niños deberían retomar las clases presenciales a tiempo completo en otoño con la implementación de estrategias de prevención estratificadas.
ACTUALIZACIÓN
La Casa Blanca anunció que todos los viajeros internacionales que ingresan a los Estados Unidos deberán estar vacunados y este requisito comenzará a regir a partir del 8 de noviembre de 2021. Para poder ingresar a los Estados Unidos, se aceptarán las vacunas aprobadas o autorizadas por la FDA y las vacunas incluidas en la lista de uso de emergencia de la OMS. Hay más información disponible aquí.
ACTUALIZACIÓN
Los requisitos de viaje para ingresar a los Estados Unidos se modificarán a partir del 8 de noviembre del 2021. Hay más información disponible aquí.

Clasificaciones y definiciones de las variantes del SARS-CoV-2

Clasificaciones y definiciones de las variantes del SARS-CoV-2
Actualizado el 1 de dic. del 2021

Los virus como el SARS-CoV-2 evolucionan constantemente a medida que se producen cambios en el código genético (mutaciones genéticas) durante la replicación del genoma. Un linaje es un grupo de variantes de virus estrechamente relacionados desde el punto de vista genético derivados de un ancestro en común. Una variante tiene una o más mutaciones que la diferencian de las otras variantes de los virus del SARS-CoV-2. Tal como se preveía, se han documentado múltiples variantes del SARS-CoV-2 en los Estados Unidos y a nivel mundial durante esta pandemia. Para fundamentar las investigaciones de brotes locales y comprender las tendencias nacionales, los científicos comparan las diferencias genéticas entre los virus para identificar las variantes y cuán estrecha es su relación entre sí.

Definiciones clave

  • Mutación: una mutación se refiere a un cambio único en el genoma del virus (código genético). Las mutaciones ocurren con frecuencia, pero solo a veces modifican las características del virus.
  • Linaje: un linaje es un grupo de virus estrechamente relacionados con un ancestro en común. El SARS-CoV-2 tiene muchos linajes; todos causan el COVID-19.
  • Variante: una variante es un genoma viral (código genético) que puede incluir una o más mutaciones. En algunos casos, un grupo de variantes con cambios genéticos similares, como un linaje o grupo de linajes, puede ser designado por las organizaciones de salud pública como una variante de preocupación (VOC, por sus siglas en inglés) o una variante de interés (VOI, por sus siglas en inglés) debido a atributos y características compartidas que pueden requerir medidas de salud pública.

Puntos clave

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  • Han surgido y circulado linajes genéticos del SARS-CoV-2 en todo el mundo desde el comienzo de la pandemia de COVID-19.
  • Los linajes genéticos del SARS-CoV-2 en los Estados Unidos se monitorean de manera rutinaria a través de investigaciones epidemiológicas, vigilancia de la secuencia genética de los virus y estudios de laboratorio.
  • El 30 de noviembre del 2021, el grupo interagencias del SARS-CoV-2 (SIG) del gobierno de los EE. UU. clasificó a la variante ómicron como variante de preocupación (VOC). Esta clasificación se basó en lo siguiente:
    • La detección de casos atribuidos a la variante ómicron en varios países, incluso entre quienes no habían viajado.
    • Transmisión y reemplazo de la variante delta en Sudáfrica.
    • La cantidad y ubicaciones de las sustituciones en la proteína S.
    • Datos disponibles de otras variantes con menos sustituciones en la proteína S que indican una reducción en la neutralización por sueros de personas vacunadas o convalecientes.
    • Datos disponibles de otras variantes con menos sustituciones en la proteína S que indican una menor susceptibilidad a ciertos tratamientos de anticuerpos monoclonales.
  • El esquema de clasificación de variantes del SIG define cuatro clases de variantes del SARS-CoV-2:
  • Hasta la fecha, no se ha identificado ninguna variante de gran consecuencia en los Estados Unidos.
  • Las vacunas aprobadas y autorizadas para su uso en los Estados Unidos son efectivas contra la variante predominante que está circulando en los Estados Unidos y existen tratamientos efectivos disponibles. Los CDC siguen monitoreando todas las variantes que circulan en los Estados Unidos.
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Cómo se clasifican las variantes 

El Departamento de Salud y Servicios Humanos (HHS) de los EE. UU. estableció un grupo entre agencias por el SARS-CoV-2 (SIG) para mejorar la coordinación entre los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC), los Institutos Nacionales de la Salud (NIH), la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA), la Autoridad de Investigación Biomédica Avanzada y de Desarrollo (BARDA), y el Departamento de Defensa (DoD). Este grupo entre agencias se centra en la rápida caracterización de las variantes emergentes y monitorea activamente su posible impacto en las contramedidas críticas contra el SARS-CoV-2, incluidas las vacunas, los tratamientos y el diagnóstico.

El SIG se reúne regularmente para evaluar el riesgo que representan las variantes del SARS-CoV-2 que circulan en los Estados Unidos y para elaborar recomendaciones acerca de la clasificación de las variantes. Esta evaluación está a cargo de un grupo de expertos en la materia que evalúa los datos disponibles, incluida la proporción de las variantes a nivel nacional y regional y el posible impacto conocido de la constelación de mutaciones sobre la efectividad de las contramedidas médicas, la gravedad de la enfermedad y la capacidad de propagación de persona a persona. Dada la continua evolución del SARS-CoV-2 y nuestro entendimiento del impacto de las variantes sobre la salud pública, las variantes pueden reclasificarse con base en sus atributos y prevalencia en los Estados Unidos.

Notas: Todas las clasificaciones de variantes incluyen los posibles atributos de las clases más bajas (por ejemplo, la VOC incluye posibles atributos de la VOI); el estado de la variante podría subir o bajar en su clasificación con base en la evidencia científica que vaya surgiendo. Esta página se actualizará según sea necesario para mostrar las variantes que pertenecen a cada clase. La Organización Mundial de la Salud (OMS) ícono de sitio externo también clasifica a las variantes del virus como variantes de preocupación y variantes de interés; las clasificaciones estadounidenses pueden diferir de las de la OMS porque el impacto de las variantes puede ser distinto en cada lugar. Para ayudar al público en la distinción de las variantes, la OMS propuso el uso de nomenclaturas con el alfabeto griego (por ejemplo, alfa, beta, gamma) como forma práctica para referirse a las variantes frente a públicos no científicos. Las nomenclaturas asignadas a cada variante se pueden ver en la tabla de abajo.

Variante bajo monitoreo (VBM, por sus siglas en inglés)

Los CDC monitorean todas las variantes que circulan en los Estados Unidos. Las variantes designadas como VBM incluyen aquellas cuyos datos indican que existen un impacto claro o potencial sobre las contramedidas médicas aprobadas o autorizadas o que se han asociado a casos de enfermedad más graves o a una mayor transmisión pero que ya no se detectan, o están circulando a niveles muy bajos, en los Estados Unidos. Estas variantes no representan un riesgo significativo e inminente para la salud pública en los Estados Unidos.

Una variante de interés o una variante de preocupación puede ser degradada a esta lista luego de una reducción significativa y sostenida en sus proporciones nacionales y regionales con el paso del tiempo, o si otra evidencia indica que una variante no representa un riesgo significativo para la salud pública en los Estados Unidos.

Estas variantes se siguen monitoreando de cerca para identificar cambios en sus proporciones y los nuevos datos obtenidos se analizan de forma continua. Si los datos indican que una VBM justifica un mayor nivel de preocupación, se modificará la clasificación con base en la evaluación que haga el SIG de los atributos de la variante y el riesgo para la salud pública en los Estados Unidos.

Variantes bajo monitoreo
Nomenclatura de la OMS  Linaje Pango Fecha de designación
Alfa Linajes B.1.1.7 y Q VOC: 29 de diciembre del 2020 VBM: 21 de septiembre del 2021
Beta Linajes B.1.35 y descendientes VOC: 29 de diciembre del 2020 VBM: 21 de septiembre del 2021
Gamma Linajes P.1 y descendientes VOC: 29 de diciembre del 2020 VBM: 21 de septiembre del 2021
Epsilon B.1.43
B.1.43
VOC: 19 de marzo del 2021 VOI: 26 de febrero del 2021
VOI: 29 de junio del 2021
VBM: 21 de septiembre del 2021
Eta B.1.52 VOI: 26 de febrero del 2021 VBM: 21 de septiembre del 2021
Iota B.1.53 VOI: 26 de febrero del 2021 VBM: 21 de septiembre del 2021
Kappa B.1.617.1 VOI: 7 de mayo del 2021 VBM: 21 de septiembre del 2021
N/A B.1.617.3 VOI: 7 de mayo del 2021 VBM: 21 de septiembre del 2021
Zeta P.2 VOI: 26 de febrero del 2021 VBM: 21 de septiembre del 2021
Mu B.1.62B.1.621.1 VBM: 21 de septiembre del 2021

Variante de interés (VOI, por sus siglas en inglés)

Variante con marcadores genéticos específicos a los que se ha asociado a cambios en la unión al receptor, una menor neutralización por los anticuerpos generados contra una infección anterior o la vacunación, una menor eficacia de los tratamientos, el posible impacto del diagnóstico, o el aumento pronosticado en la transmisibilidad o gravedad de la enfermedad.

Posibles atributos de una variante de interés:

  • Marcadores genéticos específicos que se puede predecir que afectarán la transmisión, el diagnóstico, los tratamientos o el escape inmunitario.
  • Evidencia de que esta sea la causa de un aumento en la proporción de casos o de clústeres de brotes particulares.
  • Prevalencia o expansión limitadas en los Estados Unidos o en otros países.

Una variante de interés podría requerir una o más medidas de salud pública adecuadas, incluida una mejor vigilancia secuencial, una mejor caracterización de laboratorio o investigaciones epidemiológicas para evaluar con qué facilidad se propaga el virus a otras personas, la gravedad de la enfermedad, la eficacia de los tratamientos y si las vacunas aprobadas o autorizadas actualmente ofrecen protección.

Actualmente, ninguna de las variantes del SARS-CoV-2 tiene la designación de VOI.

Variante de preocupación (VOC, por sus siglas en inglés)

Variante para la cual existe evidencia de una mayor transmisibilidad, casos más graves de enfermedad (por ejemplo, mayor cantidad de hospitalizaciones o muertes), reducción significativa en la neutralización por los anticuerpos generados durante una infección anterior o la vacunación, menor efectividad de los tratamientos o las vacunas, o fallas de detección de diagnóstico.

Posibles atributos de una variante de preocupación:

Además de los posibles atributos de las variantes de interés:

  • Evidencia del impacto sobre el diagnóstico, los tratamientos o las vacunas
    • Interferencia generalizada con los objetivos de las pruebas de diagnóstico​​​​​​​
    • Evidencia de susceptibilidad sustancialmente menor a una o más clases de tratamientos
    • Evidencia de neutralización significativamente menor por los anticuerpos generados durante una infección previa o la vacunación
    • Evidencia de una menor protección inducida por la vacuna ante enfermedades graves
  • Evidencia de mayor transmisibilidad
  • Evidencia de mayor gravedad de la enfermedad

Variants of concern might require one or more appropriate public health actions, such as notification to WHO under the International Health Regulations, reporting to CDC, local or regional efforts to control spread, increased testing, or research to determine the effectiveness of vaccines and treatments against the variant. Con base en las características de la variante, las consideraciones adicionales pueden incluir la elaboración de nuevos diagnósticos o la modificación de las vacunas o tratamientos. 

Las variantes de preocupación actuales en los Estados Unidos que están siendo monitoreadas estrechamente y caracterizadas figuran en la lista de abajo. Esta lista se actualizará cuando se identifique alguna otra variante de preocupación.

Características de ciertas variantes del SARS-CoV-2

Nomenclatura de la OMSdelta

Linaje Pango: Linajes B.1.617.2 y AY (Linaje Pangoícono de sitio externo)a

Sustituciones de la proteína ST19R, (V70F*), T95I, G142D, E156-, F157-, R158G, (A222V*), (W258L*), (K417N*), L452R, T478K, D614G, P681R, D950N 

Clado Nextstrain (Nextstrainícono de sitio externo)b21A/S:478K

Identificad por primera vez en: India

Características:

  • Mayor transmisibilidad29
  • Casi todos los linajes designados como delta son susceptibles a los tratamientos con anticuerpos monoclonales con Autorización de Uso de Emergencia (EUA, por sus siglas en inglés). Los linajes AY.1 y AY.2 no son susceptibles a algunos de los tratamientos con anticuerpos monoclonales.7, 14
  • Reducción en la neutralización por sueros postvacunación21

Nomenclatura de la OMS: ómicron

Linaje Pango: linajes B.1.1.529 y BA (Linaje Pangoícono de sitio externo)a

Sustituciones de la proteína S: A67V, del69-70, T95I, del142-144, Y145D, del211, L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F

Clado Nextstrain (Nextstrainícono de sitio externo)b: 21K

Identificada por primera vez en: Sudáfrica

Características:

  • Posible mayor transmisibilidad
  • Posible reducción en la neutralización con algunos tratamientos de anticuerpos monoclonales con EUA
  • Posible reducción en la neutralización por sueros postvacunación

Variante con grandes consecuencias (VOHC, por sus siglas en inglés)

La variante VOHC muestra una clara evidencia de que las medidas de prevención o las medidas médicas paliativas (MCM, por sus siglas en inglés) han reducido significativamente la efectividad con respecto a las variantes que circularon previamente.

Posibles atributos de una variante de gran consecuencia:

Además de los posibles atributos de las variantes de preocupación:

  • Impacto sobre las MCM
    • Falla demostrada en los objetivos de pruebas de diagnóstico
    • Evidencia que sugiere una reducción significativa en la efectividad de las vacunas, una cantidad desproporcionadamente alta de casos de infección en vacunados, o muy baja protección inducida por las vacunas contra enfermedades graves
    • Reducción significativa en la susceptibilidad a múltiples tratamientos aprobados o con EUA
    • Casos más graves de enfermedad clínica y aumento de las hospitalizaciones

Una variante de gran consecuencia requeriría notificar a la OMS de conformidad con el Reglamento Sanitario Internacional, notificar a los CDC, anunciar estrategias para prevenir o contener la transmisión, y brindar recomendaciones para actualizar los tratamientos y las vacunas. 

Actualmente, ninguna de las variantes del SARS-CoV-2 tiene la designación de VOHC.

Sustituciones de variantes de preocupación para tratamientos con anticuerpos monoclonales contra el SARS-CoV-2

En los Estados Unidos existen tres tratamientos con anticuerpos monoclonales contra el SARS-CoV-2 con Autorización de Uso de Emergencia de la FDA para el tratamiento del COVID-19: bamlanivimab con etesevimabícono de sitio externocasirivimab con imdevimabícono de sitio externo y sotrovimabícono de sitio externo. 

El programa nacional de vigilancia genómica de los CDC identifica variantes nuevas y emergentes del SARS-CoV-2 para determinar las consecuencias para el diagnóstico del COVID-19, los tratamientos o las vacunas aprobadas o autorizadas para su uso en los Estados Unidos. Las secuencias con cambios genéticos similares se agrupan en linajes, y varios linajes pueden tener las mismas sustituciones. Por ejemplo, la sustitución de E484K se encuentra en los linajes B.1.35 y P.1, B.1.526, entre otros tantos. Los esfuerzos de vigilancia genómica ofrecen la capacidad de detectar más rápidamente los virus con menor susceptibilidad a los tratamientos. 

No se han notificado casos de menor susceptibilidad del SARS-CoV-2 al sotrovimabícono de sitio externo ni al tratamiento combinado con casirivimab e imdevimabícono de sitio externo . En estudios de laboratorio, las variantes del SARS-CoV-2 que contienen ciertas sustituciones en la proteína S tienen menor susceptibilidad a la combinación de bamlanivimab y etesevimabícono de sitio externo. Los médicos que deseen información sobre el uso de productos con anticuerpos monoclonales autorizados para uso de emergencia en los Estados Unidos para el tratamiento y la prevención del SARS-CoV-2 pueden consultar las Directrices de tratamiento del COVID-19 de los NIHícono de sitio externo. 

Dada la prevalencia de la variante delta en los Estados Unidos, es importante destactar que la gran mayoría de los linajes de la variante delta son sensibles a la combinación de bamlanivimab y etesevimab. Aunque las variantes delta contienen la sustitución L452R, la combinación de sustituciones L452R y T478K presente en la mayoría de las variantes delta no produce cambios en la susceptibilidad al tratamiento combinado con bamlanivimab y etesevimab, tal como se destaca en la Hoja informativa de la FDA para proveedores de atención médicaícono de sitio externo. 

Los datos de proporciones a continuación muestran las proporciones nacionales y regionales no ponderadas de SARS-CoV-2 que contienen las siguientes sustituciones de la proteína S, individualmente o combinadas, que reducen la susceptibilidad a la combinación de bamlanivimab y etesevimab y se enumeran en la Hoja informativa de la FDA para proveedores de atención médica sobre la EUA para el uso de bamlanivimab y etesevimabícono de sitio externo. Pueden añadirse más sustituciones a la lista a continuación en la medida que haya más datos disponibles. Las proporciones nacionales y regionales que se presentan a continuación se actualizarán con una frecuencia semanal. 

  • L452R 
  • E484K 
  • L452R y E484Q 
  • K417N, E484K y N501Y 
  • K417T, E484K y N501Y 
  • K417N, L452R y T478K 
  • R346K, E484K y N501Y 

Proporciones no ponderadas de sustituciones del SARS-CoV-2 de preocupación terapéutica

Sustitución de la proteína S L452R
Proporción nacionala: 93,8 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
98,3 %
Región 2
94,4 %
Región 3
97,9 %
Región 4
94,3 %
Región 5
92 %
Región 6
91,7 %
Región 7
93,9 %
Región 8
96,3 %
Región 9
91,1 %
Región 10
96,3 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc
B.1.617.2 (delta) 
AY.4 (delta) 
AY.3 (delta) 
AY.12 (delta) 
AY.3.1 (delta) 
AY.14 (delta) 
AY.20 (delta) 
AY.25 (delta) 
Sustitución de la proteína S E484K
Proporción nacionala: 0,3 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,5 %
Región 2
0,4 %
Región 3
0,2 %
Región 4
0,2 %
Región 5
0,2 %
Región 6
0,2 %
Región 7
0,1 %
Región 8
0,1 %
Región 9
0,2 %
Región 10
0,4 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc
B.1.62(Mu) 
P.1 (gamma) 
B.1.621.1 (Mu) 
P.1.7 (gamma) 
P.1.4 (gamma) 
P.1.1 (gamma) 
B.1.617.2 (delta) 
B.1.63 
B.1.63 

Sustituciones de la proteína S K417N, E484K y N501Y
Proporción nacionala<0,3 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,0 %
Región 2
0,0 %
Región 3
0,0 %
Región 4
0,0 %
Región 5
0,0 %
Región 6
0,0 %
Región 7
0,0 %
Región 8
0,0 %
Región 9
0,0 %
Región 10
0,1 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc

B.1.62 (Mu) 

B.1.35 (beta)

Sustituciones de la proteína S K417T, E484K y N501Y
Proporción nacionala: 0,1 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,2 %
Región 2
0,0 %
Región 3
0,1 %
Región 4
0,1 %
Región 5
0,1 %
Región 6
0,2 %
Región 7
0,1 %
Región 8
0,0 %
Región 9
0,1 %
Región 10
0,1 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc

P.1 (gamma) 

P.1.1 (gamma) 
P.1.2 (gamma) 
P.1.4 (gamma) 
P.1.7 (gamma) 

Sustitución L452R y E484Q de la proteína S
Proporción nacionala: 0,2 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,2 %
Región 2
0,2 %
Región 3
0,1 %
Región 4
0,1 %
Región 5
0,1 %
Región 6
0,3 %
Región 7
0,0 %
Región 8
0,1 %
Región 9
0,2 %
Región 10
0,1 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc

B.1.617.2 (delta) 
AY.4 (delta) 
AY.7.2 (delta) 

AY.25 (delta) 

AY.12 (delta) 

B.1.617.1 (kappa) 

AY.3 (delta) 

AY.20 (delta) 

Sustitución K417N, L452R y T478K de la proteína S
Proporción nacionala: 0,3 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,1 %
Región 2
0,3 %
Región 3
0,1 %
Región 4
0,1 %
Región 5
0,1 %
Región 6
0,0 %
Región 7
0,0 %
Región 8
0,2 %
Región 9
1 %
Región 10
0,3 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc

AY.2 (delta) 
AY.1 (delta) 
B.1.617.2 (delta) 

AY.25 (delta)

Sustitución R346K, E484K y N501Y de la proteína S
Proporción nacionala: 0,1 %

Porcentajes regionalesb

Región 1
0,2 %
Región 2
0,3 %
Región 3
0,1 %
Región 4
0,1 %
Región 5
0,1 %
Región 6
0,1 %
Región 7
0,0 %
Región 8
0,1 %
Región 9
0,0 %
Región 10
0,3 %
Linajes Pango comunes con sustituciones de la proteína Sc
B.1.62 (Mu) 
B.1.621.1 (Mu) 

Referencias