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Clasificaciones y definiciones de las variantes del SARS-CoV-2

Clasificaciones y definiciones de las variantes del SARS-CoV-2
Actualizado el 24 de mar. del 2021

Puntos clave:

  • Las variantes genéticas del SARS-CoV-2 han estado emergiendo y circulando por el mundo durante toda la pandemia del COVID-19.
  • Las variantes y mutaciones virales en los Estados Unidos son monitoreadas de forma rutinaria mediante la vigilancia secuencial, estudios de laboratorio e investigaciones epidemiológicas.
  • Un grupo interagencial del gobierno de los EE. UU. elaboró un esquema de clasificación de variantes que define tres clases de variantes del SARS-CoV-2:
  • Las variantes B.1.1.7, B.1.351, P.1, B.1.43 y B.1.43 que circulan en los Estados Unidos están clasificadas como variantes de preocupación

Los virus cambian constantemente a través de la mutación. Una variante tiene una o más mutaciones que la diferencian de las otras variantes en circulación. Tal como se preveía, se han documentado múltiples variantes del SARS-CoV-2 en los Estados Unidos y a nivel mundial durante esta pandemia. Para fundamentar las investigaciones de brotes locales y comprender las tendencias nacionales, los científicos comparan las diferencias genéticas entre los virus para identificar las variantes y cuán estrecha es su relación entre sí.

Clasificación de las variantes

El Departamento de Salud y Servicios Humanos (HHS) estableció un Grupo Interagencial del SARS-CoV-2 (SIG) para mejorar la coordinación entre los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) de los EE. UU., los Institutos Nacionales de la Salud (NIH), la Administración de Alimentos y Medicamentos (FDA) de los EE. UU., la Autoridad de Investigación Biomédica Avanzada y de Desarrollo (BARDA) y el Departamento de Defensa (DoD). Este grupo interagencial se enfoca en la rápida caracterización de las variantes emergentes y monitorea activamente su posible impacto en las medidas paliativas fundamentales en torno al SARS-CoV-2, incluidas las vacunas, los tratamientos y el diagnóstico.

En colaboración con el SIG, los CDC establecieron un esquema de clasificación para las variantes del SARS-CoV-2. Estas clasificaciones incluyen definiciones y atributos de las variantes. Las medidas de salud pública resultantes también se describen en las siguientes secciones.

Notes: Each class of variant includes the possible attributes of lower classes; variant status might escalate or deescalate based on scientific evidence. Esta página se actualizará según sea necesario para mostrar las variantes que pertenecen a cada clase. The World Health Organization (WHO) also classifies variant viruses as Variants of Concern and Variants of Interest; US classifications may differ from those of WHO since the importance of variants may differ by location.

Vea Proporciones de las variantes en los Estados Unidos

Variante de interés

Variante con marcadores genéticos específicos a los que se ha asociado a cambios en la unión al receptor, una menor neutralización por los anticuerpos generados contra una infección anterior o la vacunación, una menor eficacia de los tratamientos, el posible impacto del diagnóstico, o el aumento pronosticado en la transmisibilidad o gravedad de la enfermedad.

Posibles atributos de una variante de interés:

  • Marcadores genéticos específicos que se prevé que afecten la transmisión, el diagnóstico, los tratamientos o el escape inmunitario
  • Evidencia que demuestra que es la causa de una mayor proporción de casos o grupos de brotes particulares
  • Prevalencia o expansión limitada en los EE. UU. o en otros países

Una variante de interés podría requerir una o más medidas de salud pública adecuadas, incluida una mejor vigilancia secuencial, una mejor caracterización de laboratorio o investigaciones epidemiológicas para evaluar con qué facilidad se propaga el virus a otras personas, la gravedad de la enfermedad, el riesgo de reinfección, y si las vacunas autorizadas actualmente ofrecen protección.

Las actuales variantes de interés en los Estados Unidos que están siendo monitoreadas y caracterizadas se detallan en la siguiente tabla. La tabla se actualizará cuando se identifique una nueva variante de interés.

Características seleccionadas de las variantes del SARS-CoV-2 más preocupantes
Nombre
(
linaje Pango) 
Sustitución Nombre
(Nextstraina)
Primera detección Aislado de referencia de BEIb

Atributos previstos

B.1.53 Spike: (L5F*), T95I, D253G, (S477N*), (E484K*), D614G, (A701V*)
ORF1a: L3201P, T265I, Δ3675/3677
ORF1b: P314L, Q1011H
ORF3a: P42L, Q57H
ORF8: T11I
5’UTR: R81C
20C Nueva York/noviembre del 2020
  • Posible reducción en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales
  • Posible reducción en la neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación
B.1.52 Spike: A67V, Δ69/70, Δ144, E484K, D614G, Q677H, F888L
ORF1b: P314F
ORF1a: T2007I
M: I82T
N: A12G, T205I
5’UTR: R81C
20C Nueva York/diciembre del 2020
  • Posible reducción en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales
  • Posible reducción en la neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación
P.2 Spike: E484K, D614G, V1176F
ORF1a: L3468V, L3930F
ORF1b: P314L
N: A119S, R203K, G204R, M234I
5’UTR: R81C
20J Brasil/abril del 2020
  • Posible reducción en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales
  • Posible reducción en la neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación

 

(*)=detectada en algunas secuencias pero no en todas
a – Nextstrainícono de sitio externo
b - Recursos de Investigación de Biodefensa e Infecciones Emergentes (Recursos de BEI) es un repositorio financiado por el NIAID para proporcionar reactivos, herramientas e información a la comunidad investigadora. Los virus de referencia propuestos aquí facilitan la armonización de la información entre todas las partes interesadas en la comunidad investigadora de la pandemia del COVID-19. Tenga en cuenta que los virus de referencia proporcionados en las siguientes tablas se basan en lo que está disponible actualmente a través de los recursos de BEI.

 Estas variantes comparten una mutación específica denominada D614G. Esta mutación fue una de las primeras en ser documentadas en los EE. UU. durante las primeras etapas de la pandemia, después de haber circulado inicialmente en Europa[13]. Existe evidencia de que las variantes con esta mutación se propagan más rápidamente que los virus que no tienen esta mutación [12ícono de sitio externo].

Variante de preocupación

Variante para la cual existe evidencia de una mayor transmisibilidad, casos más graves de enfermedad (mayor cantidad de hospitalizaciones o muertes), reducción significativa en la neutralización por los anticuerpos generados durante una infección anterior o la vacunación, menor efectividad de los tratamientos o las vacunas, o fallas de detección de diagnóstico.

Posibles atributos de una variante de preocupación:

Además de los posibles atributos de las variantes de interés:

  • Evidencia del impacto sobre el diagnóstico, los tratamientos y las vacunas
    • Interferencia generalizada con los objetivos de las pruebas de diagnóstico​​​​​​​
    • Evidencia de resistencia sustancialmente mayor a una o más clases de tratamientos
    • Evidencia de reducción significativa en la neutralización por anticuerpos generados durante una infección anterior o la vacunación
    • Evidencia de una menor protección inducida por la vacuna ante enfermedades graves
  • Evidencia de mayor transmisibilidad
  • Evidencia de mayor gravedad de la enfermedad

Variants of concern might require one or more appropriate public health actions, such as notification to WHO under the International Health Regulations, reporting to CDC, local or regional efforts to control spread, increased testing, or research to determine the effectiveness of vaccines and treatments against the variant. Con base en las características de la variante, las consideraciones adicionales pueden incluir la elaboración de nuevos diagnósticos o la modificación de las vacunas o tratamientos.

Las variantes actuales de preocupación en los Estados Unidos que están siendo controladas de cerca y caracterizadas por las agencias federales se incluyen en la siguiente tabla. La tabla se actualizará cuando se identifique una nueva variante de preocupación.

Características seleccionadas de las variantes del SARS-CoV-2 más preocupantes
Nombre
(linaje Pango)
Sustituciones de la proteína Spike

Nombre
(Nextstraina)

Primera detección Aislado de referencia de BEIb

Atributos conocidos

B.1.1.7 Δ69/70
Δ144Y
(E484K*)
(S494P*)
N501Y
A570D
D614G
P681H
20I/501Y.V1 Reino Unido NR-54000ícono de sitio externo
  • ~50 % de aumento de transmisión5
  • Probable aumento en la gravedad con base en las tasas de hospitalización y muerte6
  • Mínimo impacto en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales con EUA7, 14
  • Mínimo impacto en la neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación8,9,10,11,12,13,19

 

P.1 K417N/T
E484K
N501Y
D614G
20J/501Y.V3 Japón/
Brasil
NR-54982ícono de sitio externo
  • Impacto moderado en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales con EUA7,14
  • Menor neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación15
B.1.35 K417N
E484K
N501Y
D614G
20H/501.V2 Sudáfrica NR-54009ícono de sitio externo
  • ~50 % de aumento de transmisión16
  •  Impacto moderado en la neutralización por tratamientos de anticuerpos monoclonales con EUA7,14
  • Reducción moderada en la neutralización por sueros de convaleciente y postvacunación8,12,18,19,20
B.1.43 L452R
D614G
20C/S:452R EE. UU.-California
  • ~20 % de aumento de transmisibilidad21
  • Impacto significativo en la neutralización por parte de algunos tratamientos con EUA, pero no todos
  • Reducción moderada en la neutralización al utilizar sueros de convaleciente y postvacunación21
B.1.43 S13I
W152C
L452R
D614G
20C/S:452R EE. UU.-California
  • ~20 % de aumento de transmisibilidad21
  • Impacto significativo en la neutralización por parte de algunos tratamientos con EUA, pero no todos
  • Reducción moderada en la neutralización al utilizar sueros de convaleciente y postvacunación21

(*)=detectada en algunas secuencias pero no en todas
a – Nextstrainícono de sitio externo
b - Recursos de Investigación de Biodefensa e Infecciones Emergentes (Recursos de BEI) es un repositorio financiado por el NIAID para proporcionar reactivos, herramientas e información a la comunidad investigadora. Los virus de referencia propuestos aquí facilitan la armonización de la información entre todas las partes interesadas en la comunidad investigadora de la pandemia del COVID-19. Tenga en cuenta que los virus de referencia proporcionados en las siguientes tablas se basan en lo que está disponible actualmente a través de los recursos de BEI.

 Estas variantes comparten una mutación específica denominada D614G. Esta mutación fue una de las primeras en ser documentadas en los EE. UU. durante las primeras etapas de la pandemia, después de haber circulado inicialmente en Europa[13]. Existe evidencia de que las variantes con esta mutación se propagan más rápidamente que los virus que no tienen esta mutación [12ícono de sitio externo].

Variante de gran consecuencia

 La variante de gran consecuencia muestra una clara evidencia de que las medidas de prevención o las medidas médicas paliativas (MCM, por sus siglas en inglés) han reducido significativamente la efectividad con respecto a las variantes que circularon previamente.

Posibles atributos de una variante de gran consecuencia:

Además de los posibles atributos de las variantes de preocupación:

  • Impacto en las medidas médicas paliativas (MCM)
    • Falla de diagnóstico demostrada
    • Evidencia que sugiere una reducción significativa en la efectividad de las vacunas, una cantidad desproporcionadamente alta de casos en los que las vacunas no resulta efectivas, o muy baja protección inducida por las vacunas contra enfermedades graves
    • Reducción significativa en la susceptibilidad a múltiples tratamientos aprobados o con Autorización de Uso de Emergencia (EUA)
    • Casos más graves de enfermedad clínica y aumento de las hospitalizaciones

Una variante de gran consecuencia requeriría notificar a la OMS de conformidad con el Reglamento Sanitario Internacional, notificar a los CDC, anunciar estrategias para prevenir o contener la transmisión, y brindar recomendaciones para actualizar los tratamientos y las vacunas.

Actualmente, no hay variantes del SARS-CoV-2 que alcancen el nivel de gran consecuencia.

Referencias

  1. Zhou, B., Thi Nhu Thao, T., Hoffmann, D. et al.SARS-CoV-2 spike D614G change enhances replication and transmission. Nature (2021). https://doi.org/10.1/s41586-021-03361-1ícono de sitio externo
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  7. Fact Sheet For Health Care Providers Emergency Use Authorization (Eua) Of Bamlanivimab And Etesevimab 02092021 (fda.gov)ícono de sitio externo
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  10. Edara VV, Floyd K, Lai L, et al. Infection and mRNA-1273 vaccine antibodies neutralize SARS-CoV-2 UK variant. MedRxiv 2021. doi: https://doi.org/10.11/2021.02.02.21250799ícono de sitio externo
  11. Collier DA, DeMarco A, Ferreira I, et al. SARS-CoV-2 B.1.1.7 sensitivity to mRNA vaccine-elicited, convalescent and monoclonal antibodies. MedRxiv 2021. doi: https://doi.org/10.11/2021.01.19.21249840ícono de sitio externo
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*No revisado por pares