Vista general
Aunque los datos genéticos generados fueron insuficientes para clasificar el virus como un genotipo específico, los segmentos del gen del virus secuenciados se parecen más a los segmentos de los recientes virus B3.13 detectados en California en seres humanos, ganado lechero y aves de corral. Este análisis apoya la conclusión de que el riesgo general para el público en general asociado al brote del virus A(H5N1) de la HPAI en curso en el ganado lechero y las aves de corral en los Estados Unidos no cambió y por el momento sigue siendo bajo.
Información importante
Este es un resumen técnico de un análisis de los datos de la secuencia genómica de un virus A(H5N1) de la influenza de un caso pediátrico en California que fue confirmado por los CDC el 22 de noviembre.Este análisis apoya la conclusión de que el riesgo general para el público en general asociado al brote del virus A(H5N1) de la HPAI en curso en el ganado lechero y las aves de corral de los Estados Unidos no cambió y sigue siendo bajo.
Actualización de los CDC
10 de diciembre de 2024 - Como se notificó anteriormente, los CDC, en colaboración con el Departamento de Salud Pública de California (CDPH, por sus siglas en inglés), confirmaron una infección en seres humanos con el virus A(H5N1) de la influenza aviar (influenza aviar H5N1) en un niño de California el 22 de noviembre del 2024. El paciente fue detectado inicialmente como un caso sospechoso de A(H5N1) a través de pruebas de influenza y notificado al CDPH a través de la vigilancia de la influenza, con la subtipificación inicial realizada por el Laboratorio de Virología Clínica de Stanford Medicine y los resultados presuntamente positivos de las pruebas notificados por el CDPH el 19 de noviembre del 2024.
Según los valores del umbral de ciclo (Ct, por sus siglas en inglés) de la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR, por sus siglas en inglés) en tiempo real determinados durante las pruebas de diagnóstico, la muestra nasofaríngea del paciente presentaba niveles muy bajos de ARN viral de la influenza. Los intentos iniciales de secuenciar el ARN viral tanto por Stanford Medicine como por los CDC utilizando metodologías estándar de secuenciación de próxima generación produjeron amplicones débiles resultantes del proceso de PCR que eran difíciles de secuenciar utilizando metodologías de secuenciación Nanopore e Illumina. Además, los esfuerzos por aislar el virus de la muestra no tuvieron éxito. Mediante el empleo de técnicas de enriquecimiento de ácidos nucleicos, los CDC y Stanford Medicine pudieron generar los siguientes datos de secuencias de ARN viral: genes completos de neuraminidasa (NA) y nucleoproteína (NP), y genes parciales de hemaglutinina (HA), polimerasa básica 2 (PB2) y polimerasa básica 1 (PB1). Los CDC y Stanford Medicine enviaron estos datos para A/California/192/2024 a las bases de datos GISAID y GenBank con los números de acceso EPI_ISL_19597300 y PQ724471-PQ724473, respectivamente.
El análisis inicial de la secuencia, con base en fragmentos cortos de los genes HA y NA, indicó que se trataba de un virus A(H5N1) del clado 2.3.4.4b similar a los virus causantes de brotes en ganado lechero y aves de corral en los Estados Unidos. Tras obtener los genes NA y NP de longitud completa, los CDC pudieron realizar un análisis filogenético integral, que demostró que el virus era muy similar a los virus detectados tanto en ganado lechero como en aves de corral, así como a los virus A(H5N1) de infecciones en humanos anteriores en trabajadores de granjas lecheras de California. Aunque los datos genéticos generados eran insuficientes para clasificar el virus como un genotipo específico, las secuencias NA y NP compartían una estrecha identidad nucleotídica y agrupación filogenética con los genes NA y NP de los virus B3.13 recientes detectados en California en seres humanos, ganado lechero y aves de corral. Las investigaciones epidemiológicas y medioambientales no identificaron claramente una posible fuente de exposición. Dado que no se pudieron generar datos de secuencias adicionales del caso, es poco probable que se identifique la fuente de exposición del niño al virus A(H5N1), con lo que se completará la investigación sobre el genotipo y la exposición.
Además del análisis filogenético de los genes NA y NP, los CDC llevaron a cabo una evaluación de las secuencias de la muestra del virus en busca de cambios moleculares que pudieran afectar a la infectividad o transmisibilidad en seres humanos o reducir la susceptibilidad a los antivirales, como el oseltamivir. La secuencia parcial de HA, a pesar de carecer de partes del extremo 5' del gen, no presentaba cambios adicionales en los sitios antigénicos previstos en comparación con los virus candidatos para la vacuna (CVV, por sus siglas en inglés) disponibles del clado 2.3.4.4b. Tampoco se identificaron cambios en el dominio de unión a receptor del virus, lo que indica que el virus conservó las propiedades de unión a receptor aviar sin mutaciones que tuvieran un impacto en los cambios de infectividad o transmisibilidad en seres humanos. Los genes PB2 y PB1 no presentaban cambios genéticos asociados a la adaptación a los mamíferos, ni se identificaron cambios genéticos en los datos de la secuencia NA que se hayan asociado a una menor susceptibilidad a los inhibidores de la neuraminidasa, como el oseltamivir. Por último, los datos de la secuencia confirmaron que el virus de este caso no está estrechamente relacionado con el virus que causó una enfermedad grave en un ser humano en Columbia Británica, Canadá. En conjunto, estos datos indican que el virus detectado en este caso pediátrico es muy similar a la mayoría de los demás virus A(H5N1) de la influenza detectados en los Estados Unidos y no presenta signos de mutaciones preocupantes.
Si bien los datos de secuencia obtenidos no permiten determinar definitivamente el genotipo viral, y no se identificó ninguna fuente específica de exposición animal, estos hallazgos proporcionan información contextual importante y ayudan a fundamentar la evaluación general de riesgos de los CDC. También destacan el valor de un enfoque colaborativo para esta respuesta, incluidas las evaluaciones de riesgo virológico con base en datos genéticos.
Acciones de seguimiento
Las infecciones en humanos esporádicas con un nuevo virus de la influenza en las que no se identifica la exposición animal no son infrecuentes y se produjeron durante el actual brote de influenza aviar H5N1 en el ganado lechero y las aves de corral de los EE. UU. y en brotes anteriores en todo el mundo. Este caso no cambia la evaluación de los CDC del riesgo inmediato para el público en general, que sigue siendo bajo en este momento.
No hay evidencia de contagio entre personas del virus H5N1 en California ni en ningún otro lugar de los Estados Unidos. Sin embargo, las personas con exposición laboral a animales infectados, como los matarifes de aves de corral, los trabajadores de granjas avícolas y los trabajadores de granjas lecheras, corren un mayor riesgo de infección por el virus A(H5N1) de la influenza. La vigilancia de la salud pública y las investigaciones de todos los casos identificados continuarán a nivel local, estatal y federal; controlarán los cambios preocupantes en la epidemiología de los casos en seres humanos o los cambios en los virus A(H5N1) de la influenza que podrían indicar una mayor amenaza a la salud pública, que podría incluir resultados más graves en las personas que actualmente están en riesgo de exposición e infección, o un mayor riesgo para el público en general.